Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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