Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Traf3ip1Q149C2 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Traf3ip1Q149C2 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms