Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sh3bp1P55194 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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