Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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