Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd10P28359 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms