Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd9P28357 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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