Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccl20O89093 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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