Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cldn4O35054 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cldn4O35054 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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