Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Gm379J3QQ19 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Gm379J3QQ19 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms