Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ApobE9Q414 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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