Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
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Ccdc171E9Q1U1 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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Ccdc171E9Q1U1 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms