Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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Hmcn1D3YXG0 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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Hmcn1D3YXG0 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Hmcn1D3YXG0 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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