Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Chmp3Q9CQ10 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Chmp3Q9CQ10 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms