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| Rai1 | Q61818 | Selenok-ps4-201 | ENSMUST00000178835 | 277 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| Rai1 | Q61818 | Ranbp2-ps7-201 | ENSMUST00000183924 | 384 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm38113-201 | ENSMUST00000193704 | 201 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm44142-201 | ENSMUST00000203358 | 311 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
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| Rai1 | Q61818 | AC163033.1-201 | ENSMUST00000218608 | 157 nt | BASIC | 0.56 | □□□□□ -2.32 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Defb50-201 | ENSMUST00000078879 | 373 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.54 | □□□□□ -2.32 | | |
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| Rai1 | Q61818 | AC116465.1-201 | ENSMUST00000220324 | 235 nt | BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Stfa2l1-201 | ENSMUST00000079184 | 414 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.53 | □□□□□ -2.32 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm23145-201 | ENSMUST00000178912 | 79 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm44395-201 | ENSMUST00000197056 | 153 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm44923-201 | ENSMUST00000206673 | 85 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | AC121844.1-201 | ENSMUST00000218706 | 137 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Snord68-201 | ENSMUST00000082516 | 86 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Snord32a-201 | ENSMUST00000083285 | 83 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm26066-201 | ENSMUST00000083385 | 109 nt | BASIC | 0.52 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm22281-201 | ENSMUST00000157198 | 103 nt | BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm22802-201 | ENSMUST00000175621 | 89 nt | BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Cypt14-201 | ENSMUST00000179096 | 508 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm23299-201 | ENSMUST00000082708 | 79 nt | BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm22572-201 | ENSMUST00000082985 | 105 nt | BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm23093-201 | ENSMUST00000083450 | 102 nt | BASIC | 0.51 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Xlr4d-ps-201 | ENSMUST00000118894 | 646 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm24799-201 | ENSMUST00000178431 | 79 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm25121-201 | ENSMUST00000179846 | 79 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm26914-201 | ENSMUST00000182262 | 223 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm27607-201 | ENSMUST00000185162 | 122 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | Gm45815-201 | ENSMUST00000220241 | 146 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | CT009718.4-201 | ENSMUST00000221881 | 109 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Gm43810-201 | ENSMUST00000201018 | 232 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
| Rai1 | Q61818 | AC153968.2-201 | ENSMUST00000215579 | 1140 nt | BASIC | 0.5 | □□□□□ -2.33 | | |
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| Rai1 | Q61818 | Mir465c-2-201 | ENSMUST00000104757 | 81 nt | BASIC | 0.49 | □□□□□ -2.33 | | |