Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Sh3bp1P55194 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms