Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Hoxd10P28359 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd10P28359 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms