Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd9P28357 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd9P28357 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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