Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccl20O89093 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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