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Protein–RNA interactions for Protein: O35054
Cldn4, Claudin-4, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn4
O35054
Olfr659-202
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TSL 5
BASIC
2.13
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Olfr857-203
ENSMUST00000217450
2271 nt
TSL 3
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
AC122828.3-201
ENSMUST00000223019
3915 nt
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Igkv17-127-201
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341 nt
APPRIS ALT2
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Igkv17-121-201
ENSMUST00000103315
350 nt
APPRIS ALT2
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm11786-201
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm25410-201
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BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm12580-201
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1751 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Ifi203-209
ENSMUST00000156895
3605 nt
APPRIS ALT2
TSL 1 (best)
BASIC
2.12
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Olfr801-203
ENSMUST00000213294
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm23010-201
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126 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Mir881-201
ENSMUST00000104844
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm22713-201
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm22678-201
ENSMUST00000116974
101 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm26345-201
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm23642-201
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm35077-201
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275 nt
TSL 3
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm45092-201
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TSL 3
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm45791-201
ENSMUST00000212908
352 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm25402-201
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131 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm24042-201
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103 nt
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Vmn1r178-205
ENSMUST00000227993
2518 nt
APPRIS P1
BASIC
2.11
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
AC164297.1-201
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1561 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm13219-201
ENSMUST00000144870
3019 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm24049-201
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100 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm14215-201
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BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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123 nt
BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm27540-201
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BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm29657-201
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BASIC
2.1
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Gm26265-202
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
Mir7217-201
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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TSL 5
BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
2.09
□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.07
Cldn4
O35054
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TSL 3
BASIC
2.09
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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TSL 2
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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TSL 5
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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103 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
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O35054
Ear-ps4-201
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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94 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm25615-201
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94 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm28453-203
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189 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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ENSMUST00000187456
189 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm37579-201
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm42672-201
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352 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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83 nt
TSL 5
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm18991-201
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
AC123709.1-201
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Mirlet7c-1-201
ENSMUST00000083623
94 nt
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Il1rapl1-202
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TSL 1 (best)
BASIC
2.08
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm25664-201
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107 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
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BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm24900-201
ENSMUST00000158128
134 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm25024-201
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104 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Trbv18-201
ENSMUST00000194256
294 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Mir7232-201
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74 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Igkv13-55-1-201
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308 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
Cldn4
O35054
Gm44182-201
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115 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
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