Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c2J3QNM1 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms