Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ApobE9Q414 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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