Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms