Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Pggt1bQ8BUY9 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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