Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Vipas39Q8BGQ1 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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Vipas39Q8BGQ1 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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Vipas39Q8BGQ1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Vipas39Q8BGQ1 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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Vipas39Q8BGQ1 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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