Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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