Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp1P55194 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms