Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccl20O89093 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms