Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nedd9O35177 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms