Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cldn4O35054 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn4O35054 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms