Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms