Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
Usp9yF8VPU6 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Usp9yF8VPU6 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Usp9yF8VPU6 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Usp9yF8VPU6 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms