Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ApobE9Q414 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ApobE9Q414 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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