Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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Ccdc171E9Q1U1 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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Ccdc171E9Q1U1 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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Ccdc171E9Q1U1 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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