Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r10W4VSP8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms