Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms