Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt16Q9Z2K1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms