Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Robo3Q9Z2I4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Robo3Q9Z2I4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms