Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms