Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk1bQ9Z2C6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms