Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms