Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms