Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms