Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms