Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms