Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms