Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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