Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms