Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms