Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clcn5Q9WVD4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms