Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms